NGS – 明報健康網 - 必威进入 //www.afterroberto.com 明報健康網 Thu, 05 Oct 2023 06:36:59 +0000 en-US hourly 1 https://wordpress.org/?v=6.6.2 //www.afterroberto.com/wp-content/uploads/2023/08/cropped-homelogo-1-32x32.png NGS – 明報健康網 - 必威进入 //www.afterroberto.com 32 32 【懷孕準備】遺傳病?高齡生育?慣性流產? 基因檢測有助篩選異常染色體 減遺傳病風險 增受孕機率 //www.afterroberto.com/%e6%87%b7%e5%ad%95%e6%ba%96%e5%82%99-%e9%81%ba%e5%82%b3%e7%97%85-%e9%ab%98%e9%bd%a1%e7%94%9f%e8%82%b2-%e6%85%a3%e6%80%a7%e6%b5%81%e7%94%a2-%e5%9f%ba%e5%9b%a0/ Thu, 04 Jun 2020 07:32:17 +0000 //www.afterroberto.com/?p=27025 準備生育的爸媽,最大的願望當然是孩子順利出生、健康成長。不過,若家族中有遺傳病史(如地中海貧血、一些癌症或隱性基因遺傳病等)、有慣性流產或屬高齡產婦的女士,要顧慮的事情便會更多!隨着基因檢測技術愈趨進步和普及,經醫生評估和診斷後,有需要的準爸爸媽媽是可以透過「新一代基因排序技術」(Next-Generation Sequencing, NGS)進行「胚胎植入前染色體數目異常基因檢測」(PGT-A)或「胚胎植入前基因檢測—單基因病變 / 染色體結構變異」(PGT-M / SR)等檢測,配合體外受孕(IVF)療程,在胚胎移植前查找是否有異常的染色體、分析基因異常疾病、篩選正常胚胎,以減少將遺傳病傳下一代和提高受孕的機會。

【懷孕準備】遺傳病?高齡生育?慣性流產? 基因檢測有助篩選異常染色體 減遺傳病風險 增受孕機率
並非每對準父母都需要考慮進行基因檢測!究竟哪些人有需要或適合進行基因檢測呢?

準備懷孕者注意:家族性遺傳病、高齡生育、慣性流產

betway体彩 生殖醫學科專科醫生鄧靄珊醫生指出,在本港甲型地中海貧血的比例相當高,約100人中就有3至4人帶有這個病症的基因,重型患者甚至需要接受長期輸血治療。不少準備結婚人士都會考慮接受婚前檢查,一般婚前檢查並不會涵蓋所有遺傳病的檢查,通常只會包括較常見的地中海貧血。

【懷孕準備】遺傳病?高齡生育?慣性流產? 基因檢測有助篩選異常染色體 減遺傳病風險 增受孕機率
betway体彩 生殖醫學科專科醫生鄧靄珊醫生強調,並非每一對準父母都需要進行基因檢測,即使進行檢測,除了必須先做臨牀診斷和評估外,亦必須要有充足的心準備,因基因檢測不可能百分百完全準確。

此外,還有很多屬隱性基因的遺傳病,難以從一般婚前檢查中知曉。鄧醫生指出,若夫婦倆有以下的情况,包括:

  • 高齡婦女
  • 多次體外受孕失敗
  • 慣性流產

又或是:

  • 患有嚴重遺傳病,或帶有該遺傳病的異常基因
  • 家族有嚴重遺傳病史
  • 曾誕下患有嚴重遺傳病的孩子

如在準備懷孕,可考慮諮詢醫生意見,評估一下是否需要進行基因檢測,了解自己的情况;如發現有需要,可考慮透過IVF療程,配合胚胎植入前基因檢測技術,檢查有沒有合適的胚胎可供移植,孕育下一代。

PGT-A助篩選正常胚胎 PGT-M / SR助診斷基因異常疾病

鄧醫生指出,若夫婦接受IVF療程並配合胚胎基因檢測,事前必須先做臨牀診斷和評估,以了解準父母的病史和其家族病史。如有需要,或先要找出準父母是否帶有遺傳病的異常基因。

簡單而言,為胚胎進行的基因檢測分別是PGT-A及PGT-M/SR;PGT-A有助選擇染色體數目正常的胚胎進行移植,也有助減低誕下帶有染色體異常胎兒,如唐氏綜合症等疾病的風險;至於PGT-M / SR則有助針對地檢測胚胎是否帶有準爸媽的遺傳病或異常基因,診斷是否有單基因病變或染色體結構變。

附表:

  胚胎植入前染色體數目異常檢測
(PGT-A)
胚胎植入前基因檢測— 單基因病變 / 染色體結構變異(PGT-M/SR)
適用人士 適用於高齡婦女、慣性流產及反覆着牀失敗個案,因所孕育的胚胎之染色體數目異常機率偏高 適用於想生育之遺傳病患者/ 遺傳病的異常基因攜帶者、家族有嚴重遺傳病史、曾誕下患有嚴重遺傳病的孩子
檢測重點 主要檢測胚胎染色體數目是否正確 針對檢測胚胎是否有該遺傳病之基因或染色體缺陷
檢測目的 可減少流產率、提高體外受孕成功率及減少胎兒畸形率 可減少流產率/減少胎兒畸形率,減少將嚴重的基因異常遺傳至下一代的機會

個案:缺了中指遺傳病

她表示,曾有男士及其家族成員均有先天缺了中指的個案,在他考慮生育時,擔心會遺傳給孩子。「經醫生診斷及評估後,為求診者進行了基因檢測技術,結果確定了其中一條異常的染色體,當他和太太考慮接受體外受孕療程時,便可透過基因檢測技術在胚胎植入前檢查,避免將嚴重的基因異常遺傳至下一代。」

個案:雄激素受體缺失問題基因攜帶者

另一個案是一位孕婦在首次懷孕時,接受唐氏篩查時顯示胎兒為男性(即擁有Y染色體),但其後進行超聲波掃描時,並沒有發現胎兒有男性性徵,在醫生建議下作羊膜穿刺術(抽羊水)確定胎兒擁XY染色體,經過進一步基因檢測後,發現胎兒屬於「雄激素受體缺失」的患者。

鄧醫生解釋:「胚胎基因雖為男性,但因為雄激素受體缺失,患者不能對雄性荷爾蒙作出反應,在胎兒階段未能長出男性性徵,日後其身體表徵雖為女性,但卻不會有月經等,也不能生育。」

betway体彩 分子遺傳學家陳俊良博士闡釋,以女性一方為此基因攜帶者為例,在生育下一代時,若是XY(男性)後代,有50%機會屬「雄激素受體缺失」,而XX(女性)後代呢?同樣有一半機會是攜帶者,有機會將突變基因繼續遺傳給下一代。

【懷孕準備】遺傳病?高齡生育?慣性流產? 基因檢測有助篩選異常染色體 減遺傳病風險 增受孕機率
betway体彩 分子遺傳學家陳俊良博士表示,利用NGS進行胚胎植入前基因檢測,能夠在體外受孕的療程中,檢查胚胎基因有否異常,再選擇合適的胚胎進行移植。

鄧醫生強調,這種情况無論對準父母或胎兒出生後都會帶來困擾,而透過PGT-M技術可以幫助準父母挑選沒有攜帶該基因的胚胎作移植。

家族遺傳乳癌、大腸癌 檢測助減低基因突變風險

基因檢測技術早已用於遺傳性癌症基因檢測,陳博士表示,部分常見的癌症如乳癌、大腸癌等都屬於家族遺傳性,當家族病史經常出現某種癌症,便有可能遺傳了該腫瘤基因,採用PGT-M / SR技術有望幫助減低這些基因突變遺傳至下一代的風險。

技術近年亦不斷發展,以往一些例如攜有染色體平衡易位、倒位等隱性基因問題的個案,可能需要邀請其他家族成員同時進行基因檢測,以收集大量基因資料,才可找出問題所在;但隨着引入新技術,提高了檢測的準確度及效率,只需為求診準父母進行基因檢測,找到雙方/其中一位是否帶有不正常基因之外,更可能透過此結果,應用到整個家族作比對,以助找出其他家人有否擁有相同致病基因。

助高齡生育、慣性流產婦女  增加受孕率

根據政府統計處於2018年12月發表的《1981年至2017年香港生育趨勢》的資料顯示,在2003年至2017年間,年齡組別30至34歲及35至39歲女性的生育率分別上升47%及104%,這跟本港女性遲婚的趨勢有關。

鄧醫生強調,女性卵子的品質會隨着年紀增長而變差,連帶形成的胚胎出現隨機性染色體數目異常的機會也會增多,胚胎的着牀率也會減低。「透過檢測胚胎的染色體數目是否正常後才植入母體,能提高着牀機會,減低流產或誕下帶有染色體異常胎兒的風險,如唐氏綜合症。」

陳博士指出,正常人擁有23對即46條染色體,但為了提高高齡婦女的受孕機會,經評估後可以抽取胚胎細胞進行PGT-A,檢測胚胎細胞內染色體的數目是否正常。

懷孕前需要基因檢測嗎?

不過,鄧醫生提醒,並非每對準父母都需要考慮進行基因檢測,缺乏臨牀診斷和家族病史的檢測有如「大海撈針」。鄧醫生和陳博士提醒,在決定進行基因檢測前,要清楚了解任何先進技術都有可能出現誤差,非百分百準確,胚胎也有可能在抽取細胞過程中受到破壞,因此父母雙方要有充足的心理準備,作出取捨和平衡。

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分子腫瘤專家組 拆解基因密碼 度身設計治癌 //www.afterroberto.com/%e5%88%86%e5%ad%90%e8%85%ab%e7%98%a4%e5%b0%88%e5%ae%b6%e7%b5%84-%e6%8b%86%e8%a7%a3%e5%9f%ba%e5%9b%a0%e5%af%86%e7%a2%bc-%e5%ba%a6%e8%ba%ab%e8%a8%ad%e8%a8%88%e6%b2%bb%e7%99%8c/ Mon, 17 Dec 2018 08:12:46 +0000 //www.afterroberto.com/?p=15997 【明報專訊】分子生物科技發展一日千里,新技術、新發現對臨牀醫學的影響愈來愈大;尤其是腫瘤醫學,在生物分子科學的應用上可謂站在最前線。「分子腫瘤專家組」(Molecular Tumor Board, MTB)由腫瘤科醫生、病理科醫生、醫學遺傳學家、腫瘤基因科學家、生物信息學專家和藥理專家組成,分析利用次世代定序(NGS)的腫瘤基因,尋找治療方案及追蹤用藥後反應。

 

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個人化治療——把病人腫瘤組織送到實驗室做NGS排序,排序後的複雜基因密碼會經過生物信息學分析,再編輯成報告作臨牀參考。(明報製圖)

 

身體每個正常細胞的運作,都是由極之精密的基因系統所控制,令每個細胞互相配合成為一體。而腫瘤的形成、生長和擴散,很大程度上是由於這個複雜的基因系統出現了突變,令本來有秩序的新陳代謝出現問題而失去控制。

人類在1950年代發現基因的基本單位DNA,生命的秘密就蘊藏在DNA(A/T/G/C)組成的密碼之中。由於當年解讀密碼(DNA排序)的生物化驗相當繁複和昂貴,人類在1970年才發現第一個致癌基因(SRC)。直到2000年,集合全球生物科技力量,人類整個基因圖譜的排序才首次完成,共發現了約20,000個基因。然而這只是第一步,譯出密碼並不等於明白密碼背後的功能。

 

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個人化治療——把病人腫瘤組織送到實驗室做NGS排序,排序後的複雜基因密碼會經過生物信息學分析,再編輯成報告作臨牀參考。(jxfzsy@iStockphoto)

 

NGS排序成本大降 4周有結果

在技術水平的限制下,直至21世紀頭10年,分子生物學在臨牀生物學上的應用,只限於個別、單一的基因分析,對大部分腫瘤病人的治療沒有直接影響。對同一源頭、同一分期的腫瘤,每一個病人的治療方案都是一樣。

 

直到2000年左右,分子生物學對基因排序技術取得突破;排序成本從2008年開始大幅下降,使DNA排序的準確度、速度大幅提升,從而逐漸進入臨牀應用階段。利用次世代定序(next generation sequencing,NGS。相關報道:goo.gl/3CA57v)作個別病人樣本的全面DNA排序,所需時間由幾個月縮減到一天以內,成本亦以幾何級數下降。分子腫瘤學研究發展加快了,新藥物研究的效率也提高了,NGS技術使個人化腫瘤治療進入臨牀使用成為可能。美國食品及藥物管理局在2017年正式認可首個NGS腫瘤基因排序平台。

 

NGS腫瘤基因排序和精準治療已經引入香港。在得到病人的同意後,腫瘤科醫生可以把病人的腫瘤組織送往海外的實驗室做NGS排序。現時的NGS排序都是由商業公司經營,不同的平台在技術層面上稍有不同,但大致都包括約300至500常見的致病基因。排序後的複雜基因密碼會經過生物信息學(bioinformatics)分析,再編輯成報告作臨牀參考。從病人簽署同意書到分析報告完成,約需4周。

 

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依報告設計——腫瘤科醫生根據NGS的分析報告,為病人設計個人化的腫瘤治療方案。(noipornpan@iStockphoto)

 

增加認知癌細胞生物特徵

腫瘤科醫生可以根據報告的建議,為病人設計個人化的腫瘤治療方案。例如肺癌細胞若帶有一種皮膚癌常見的基因突變(BRAF V600E),該肺癌病人便可以考慮使用針對皮膚癌BRAF的藥物。除了標靶治療以外,部分NGS報告亦會分析腫瘤對免疫治療或不同化療的敏感度。

 

透過先進的NGS排序科技,醫生大大增加了對癌細胞生物特徵的認知,令部分病人在臨牀治療上直接獲益。但是生物資訊的增加,同時也帶來一些難題。首先,NGS的結果可能和一些傳統化驗報告不脗合,不同平台的技術和品質控制也有參差。同一個基因內,不同位置、不同種類的突變,對基因的功能以至癌症的特徵都會有截然不同的影響。此外,如何演繹NGS報告的用藥建議亦大有學問。一個腫瘤可能帶有多個基因變化,究竟應該針對哪一種變化用藥,還是多藥一起使用,現時並沒有很好的指引。

 

追蹤分析用藥後反應

面對以上難題,香港大學醫療系統(HKU Health System)成立了分子腫瘤專家組MTB,幫助前線腫瘤科醫生更好發揮分子生物醫學的臨牀價值。MTB的專家每月定期開會,討論NGS排序個案並針對每個個案作出分析總結,亦會對個案用藥後的反應追蹤分析。MTB在海外的大型腫瘤中心已是常規服務之一,對推進個人化腫瘤治療有重要的功能。港大希望透過MTB提高本地的腫瘤醫學水平,歡迎全港腫瘤科醫生轉介個案討論研究。​

 

文:林泰忠(香港大學臨牀腫瘤科臨牀助理教授)

編輯:梁小玲

電郵:feature@mingpao.com

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